Bis 2003 konzentrierte sich das Zentrum für Ost-West-Kooperation auf öffentliche Veranstaltungen zum Thema EU-Osterweiterung und auf die Initiierung und Förderung von Begegnungen mit Repräsentanten aus polnischen Regionen sowie den Erfahrungsaustausch im Bereich deutsch-polnischer kommunaler und schulischer Partnerschaften.
Dazu kamen wissenschaftliche Vortragsveranstaltungen über die Entwicklungen in den EU-Beitrittsgebieten sowie Osteuropa. Die Veranstaltungen werden vom Zentrum in Zusammenarbeit mit den Mitgliedseinrichtungen durchgeführt.

Seit 2004 ist das Zentrum Antragsteller und Träger von EU-Projekten. Auch hier arbeitet es mit anderen Einrichtungen in der Region eng zusammen. So ist es in der Lage, an einem Netzaufbau von wissenschaftlichen und nichtwissenschaftlichen Beziehungen nach Mittel- und Osteuropa mitzuwirken und Erfahrungsaustausch mit Einrichtungen in den verschiedenen Ländern, vor allem zu Rußland und zu Polen, zu betreiben.